Este tipo de inversiones cuentan con una línea de ayudas financiada con fondos provenientes de la Unión Europea (a través del Instrumento Financiero de Orientación a la Pesca (IFOP), el Ministerio de Agricultura y la Consejería de Agricultura y Desarrollo Económico. Para el período 2000-2006, La Rioja cuenta con una asignación del IFOP de 1.242.000 euros, destinados a apoyar acciones de desarrollo y modernización del tejido productivo y distributivo, mediante ayudas a la acuicultura, por un lado, y a la transformación y comercialización, por otro.
Las ayudas a la acuicultura se dirigen a la creación de piscifactorías y a las inversiones realizadas en este tipo de instalaciones para afrontar su mejora. En cuanto a las subvenciones para la transformación y comercialización, están destinadas a las industrias transformadoras y conserveras, de las que tenemos algunos ejemplos en nuestra Comunidad Autónoma que se dedican a la salazón de anchoa, conservas de pescado-marisco, atún y bonito en conserva, y secaderos de bacalao, entre otras actividades.
Gobierno LaRioja