Como parte de una búsqueda para descubrir mejores maneras de controlar las enfermedades entéricas virales en las aves, científicos del Servicio de Investigación Agrícola (ARS) han desenterrado muchos virus, incluyendo algunos no previamente conocidos en las aves de corral, con la utilización de una nueva herramienta poderosa llamada la metagenómica.
Cada año, enfermedades tales como el síndrome de mortalidad de pavipollos por enteritis, el complejo de enteritis del pavipollo, y el síndrome de crecimiento retardado causan diarrea en los pavos y las aves de corral, llevando a reducciones en el peso, la muerte, y aumentos en los costos de producción de las aves. Algunos de los virus se han asociado con las enfermedades entéricas o intestinales, pero no se ha encontrado ningún solo agente causativo.
Diferente de la secuenciación tradicional que caracteriza los genes en un solo organismo, la metagenómica detecta el ácido nucleico de miles de organismos en una comunidad entera. Usando esta técnica, Laszlo Zsak, quien is líder de la Unidad de Investigación de Enfermedades Endémicas Virales de Aves de Corral en el Centro del Sudeste para Investigación de Aves de Corral mantenido por el ARS en Athens, Georgia, descubrió un nuevo virus que podría tener un papel en tratamientos antimicrobianos en el futuro.
Zsak y microbiólogo Michael Day, quien también trabaja en el laboratorio del ARS en Athens, descubrieron una secuencia corta del ADN del virus y diseñaron una técnica para secuenciar el genoma entero del virus. El virus, el cual se llama ‘phiCA82’, es un tipo de virus que naturalmente mata las bacterias y es un miembro de un grupo conocido con ‘micrófagos’ o ‘fagos’, los cuales podrían ser usados como alternativas al uso de antibióticos, y como herramientas para combatir los patógenos que tienen resistencia a múltiples drogas.
En el estudio, los científicos extrajeron y analizaron el ácido nucleico de muestras intestinales colectadas en EE.UU. de bandadas comerciales de aves de corral infectadas con enfermedades entéricas. Además del fago novedoso, los investigadores detectaron algunos virus comunes en las aves de corral, tales como astrovirus, reovirus, rotavirus, y virus de la familia Picornaviridae. Sin embargo, los investigadores también descubrieron algunos virus no previamente conocidos en los pavos, tales como picobirnavirus, el cual es un virus implicado en las enfermedades entéricas en otros animales agrícolas, y un calicivirus, el cual es un tipo de virus a menudo asociado con las enfermedades entéricas en los seres humanos.
En estudios previos, Zsak y Day usaron la metagenómica para identificar y analizar por primera vez el genoma entero de un parvovirus novedoso de la ave de corral. También desarrollaron una prueba basada en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) que es muy sensible y específica en la detección de virus en las aves.
Lea más sobre esta investigación en la revista ‘Agricultural Research’ de abril del 2012.
ARS