El Reglamento de la Comisión es aplicable desde el día 1 de enero del 2008 y deroga 20 reglamentos de aplicación anteriores, publicados en el periodo comprendido entre los años 1994 y 2006. Sin embargo, los reglamentos derogados seguirán aplicándose cuando proceda a los programas operativos aprobados, y que sigan realizándose hasta su finalización sin ser modificados.
El Reglamento 1182/2007 del Consejo de 26 de septiembre de 2007 prevé que los programas operativos podrán seguir aplicándose hasta su finalización sin modificaciones, podrán ser modificados para adaptarse a la nueva reglamentación o podrán ser sustituidos por nuevos programas aprobados de conformidad con la nueva reglamentación.
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